Quelles sont vos premières impressions et souvenirs quand on parle de bactéries, champignons et virus ? Sont-ils positifs ou négatifs ? La maladie, l'infection, la détérioration ou la mort vous viennent à l'esprit ?

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Bien que nous ayons cette première impression erronée des micro-organismes, la plupart sont inoffensifs pour l'homme et les autres êtres vivants. Les micro-organismes jouent un rôle fondamental dans l'équilibre des écosystèmes et dans le maintien de la vie, en plus d'agir dans la génération de produits et procédés biotechnologiques ! 

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LABORATOIRE D'ECOLOGIE ET DE BIOTECHNOLOGIE MICROBIENNE

Notre laboratoire a démarré ses activités en 2009, année où le Prof. Marcos A. Soares a rejoint le département Botanique et Ecologie de l'Institut des Biosciences de l'UFMT. En 2013, le professeur Euziclei G. de Almeida a rejoint notre équipe.

Dans un premier temps, nos OBJECTIFS étaient de comprendre les processus et fonctions écologiques des interactions endophytes-plantes, et les traits fonctionnels de ce microbiote pour le développement de produits et procédés biotechnologiques. Nous démarrons actuellement une ligne de recherche qui étudie la diversité et les interactions du microbiote associé aux animaux, en particulier les arthropodes.

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Les endophytes sont des micro-organismes endosymbiotiques qui sont le plus souvent représentés par des bactéries et des champignons. Ils habitent l'intérieur de toutes les plantes étudiées jusqu'à présent, ce qui laisse penser que leur présence à l'intérieur des plantes est omniprésente.  Ces microorganismes ont différents mécanismes qui favorisent la croissance et le développement des plantes,  contribuent à la résistance de l'hôte à différents types de stress biotiques (attaques d'herbivores et de phytopathogènes) et abiotiques (sols salins , la sécheresse).

L'équipe du LABEM étudie les processus de fermentation industriels et rudimentaires, en travaillant avec des aliments indigènes et des boissons fermentées produites par les Indiens Arara, en effectuant une caractérisation microbiologique par des méthodes traditionnelles et moléculaires, des analyses physico-chimiques et nutritionnelles.

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SERVICES FOURNIS AUX PARTICULIERS ET AUX PERSONNES MORALES

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Notre équipe effectue divers services d'analyse microbiologique, détermination de l'écotoxicité et de la génotoxicité d'agents chimiques et biologiques, extraction et purification d'ADN/ARN, différents types de PCR et  

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L'équipe du LABEM est composée d'étudiants en doctorat, master et licence issus des programmes et formations suivants :

• Doctorat en Biotechnologie et Réseau Biodiversité du Midwest - UFMT

• Réseau PhD en Biodiversité et Biotechnologie  do Norte - UFMT

• Doctorat en Ecologie et Conservation de la Biodiversité - UFMT

• Master en Chimie - UFMT

• Master en Biologie Végétale - UFMT

• Master Sciences de l'Environnement - UFMT

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Collection de Microorganismes d'Intérêt Environnemental et Industriel (CMIAI)  

Le Laboratoire de Biotechnologie et Ecologie Microbiennes (LABEM) dispose actuellement de souches de champignons filamenteux et de type levure, en plus de bactéries, isolées de différentes espèces végétales : Vochysia divergens, Combretum lanceolatum, Hyptis suaveolens, Cyperus esculentus, Echinodorus scaber, Talisia subalbens, Paspalum wrightii , Polygonum acuminatum, Aeschynomene fluminensis, Paullinia cupanace Anacardium othonianum,  .  Le matériel génétique des souches CMIAI est déposé dans la banque d'ADN.

La collection CMIAI a pour objectif de conserver, d'identifier et de conserver ex situ des champignons et des bactéries endophytes isolés par des chercheurs du Laboratoire de biotechnologie et d'écologie microbienne (LABEM). L'espèce préservée est l'un des moyens de préserver la biodiversité microbienne de l'État du Mato Grosso, en plus de fournir une source de prospection pour les produits et procédés biotechnologiques.